反滲透純水設備最常見的問題是脫鹽率和產水量下降。如果其中一項或兩項都下降緩慢，可能是污垢或水垢的常見現象，要適當清洗。突然或快速的性能下降表明處理系統中存在問題或操作不當。如果有問題，要盡快解決，拖延會使反滲透膜無法恢復原來的性能。及時發現問題的前提是做好這些動作的記錄。如果發現系統脫鹽率和產水量下降，必須先對儀器進行校準，避免因儀器原因造成誤判。其次，要將記錄的運行數據“標準化”。溫度、進水TDS、回收率、使用壽命和水流量的變化都會改變脫鹽率和產水量。通過計算得到標準產水率和脫鹽率，然后與初始運行數據對比，判斷系統是否有故障。
反滲透純水設備主要有三種失效現象:水滲透率降低、鹽滲透率升高(脫鹽率降低)、壓降增大。然而，這種失敗的原因是多方面的。試著從這些失敗中找出原因。問題的本質是盡快實施對策，比如檢查維修。通過分析反滲透純水設備運行參數的變化和趨勢，可以確定故障的原因。
